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团学组织

团委·学生会

药学院团委·学生会是在学院党委领导，学院团委指导下的学生自我服务、 自我教育、自我管理的组织，成立于2002年。

580志愿者服务社

药学院580志愿者服务社成立于2006年，以“580·我帮你，让世界因互助而美丽！”为口号，开展“药芙”手工皂、“药洁”洗手液的自制活动，过期药品回收、新青年下乡、社会志愿服务、义卖捐助等公益活动。

就业指导服务中心

药学院就业指导服务中心成立于2007年，在药学院党委领导下、学院学工办指导下开展工作，是一个致力于为学院学生提供就业信息、技能培训、职业导航的服务型学生组织。

本科生创客社

药学院本科生创客社成立于2013年，是在药学院党委和团委指导下，致力于服务学院本科生科研创新人才培养、各类课题申报和创新创业竞赛的学生组织。

启航国际交流服务社

启航国际交流服务社成立于2015年，是温州医科大学首个学生国际交流服务组织，目的是提高药学院学生的国际交流意识，丰富学院学生国际交流活动，为学院培养具有国际视野的综合型人才而努力。

记者团

药学院记者团成立于2008年，致力于加大对学院学生工作的宣传力度，传递学院正能量。记者团设有摄影部和采编部两个部门。