领导体制

研究院实现理事会领导下的院长负责制，同时设立专家委员会对研究院重大技术问题进行指导或领军攻关。

机构领导

理事长：薛伟教授 温州大学副校长

院 长： 马光教授 主持全面工作　

理事会

由浙南科技城管委会、温州大学分别派员组成，负责制定研究院章程，审定发展规划和年度计划，审定年度预决算，研究决定重大事项，聘任或解聘院长等等。

业务部门

综合行政管理部负责研究院行政管理和日常事务。日常行政事务性工作，包括人事、财务、宣传、接待等，负责建立并完善各项规章制度，促进研究院各项工作的规范化管理，负责办公设备管理、维修、购置等后勤保障服务工作。

科技与产业发展部负责科技成果转移化、项目孵化投资、项目申报、专利申请、专项投资基金筹建。科技与产业发展部依托研究院，以科技成果有效转化为目标，重点推动研究院的科技、人才、信息等资源与重点行业、重点企业结合，开展技术成果推广，促进研究院科技成果转化和技术转移，以实现技术成果产业化、商品化。

资产运营管理部负责管理研究院各种科研设备的运行、维护和对外服务业务。负责执行对内对外服务功能，优化设备使用效率，负责常规技术人员培训，退工服务功能向高水平、高质量、高效率发展，持续拓展服务功能的深度和广度。