截至2024年6月，深圳大学有粤海校区、丽湖校区2个校区，校园总占地面积2·72平方千米，总建筑面积为200·74万平方米。

粤海校区

深圳大学粤海校区位于深圳市南山区南海大道3688号，建有建筑与城市规划学院、师范学院、结构工程研究所、档案馆、图书馆、实验楼等教育教学设施。

丽湖校区

深圳大学丽湖校区坐落于深圳西丽湖国际科教城，深圳市南山区学苑大道1066号。交通便利、环境幽雅、名校集群，与粤海校区相距约15公里。2017年，校区一期启用，医学部、生命与海洋科学学院、化学与环境工程学院、材料学院整体搬迁入驻；2021年，校区二期启用，经济学院、管理学院、法学院整体搬迁入驻，同年成立政府管理学院。截至2024年4月，校区占地面积约1·38平方公里（2060亩），总建筑面积约73万平方米，有在校生近1·5万人，教职工近1600人。

香港校区

深圳大学香港校区，位于香港九龙九龙湾伟业街33号德福广场一期p30。

日本东京校区

深圳大学日本东京校区，位于东京都新宿区四谷1-22-5westall大厦3f。以日本公民及其他境外公民为主要招生对象，主要开展本科层次学历教育，学生毕业后将获得深圳大学授予的学历证明及学士学位。