山西医科大学口腔医学系始建于1983年，山西医科大学口腔医院以山西医科大学口腔医学系为依托，由原口腔医学系的口腔门诊发展而来。

1997年4月20日正式开展临床诊疗工作。

1998年，山西医科大学口腔医院正式挂牌成立。

2000年11月，拥有了山西省第一个口腔医学硕士研究生培养点。

2007年5月18日，被省科协评为“山西省科技创新示范医院”。

2007年12月，口腔医学专业被山西省教育厅评为2007年山西省普通高等学校本科品牌专业。

2009年7月，被山西省卫生厅指定为“山西省口腔执业医师技能考试基地”，并先后成功承办了2009年、2010年、2011年、2012年四年的山西省口腔执业医师技能考试工作。