学校前身

山西医科大学晋祠学院

2002年6月，经山西省人民政府批准，山西医科大学晋祠学院成立，为山西医科大学二级学院。

2003年，学校首次招录医学类本科生。

2004年3月，学校被教育部确认为公办独立学院，是山西省一所医学类独立学院，具有独立法人、独立校园、独立财务、独立颁发文凭资格。

2009年，学校先后成立了自己的基础课教研室和体育课教研室，分别担负学院学生的英语课和体育课教学任务。

2014年4月4日，山西医科大学与希望教育集团签署合作举办山西医科大学晋祠学院协议。

2016年，学校被评为山西省大学生创业培训机构。

2017年，晋中校区启用，2017级新生入驻晋中校区；同年，获评山西省教育学会学生生涯规划专业指导委员会理事单位。

独立转设

晋中健康学院

2025年2月21日，教育部发布信息，同意山西医科大学晋祠学院转设为晋中健康学院，同时撤销山西医科大学晋祠学院的建制；5月17日，山西医科大学晋祠学院网站发布《晋中健康学院2025年招生章程》，学校恢复招生；5月23日，山西省人民政府批复同意设立晋中健康学院，同时撤销山西医科大学晋祠学院的建制。