根据上述职责，松原市交通局设9个内设机构：

（一）办公室。负责文电、会务、机要、档案、综合性报告、文件起草和信息、保密等机关政务、事务工作；负责机关国有资产管理工作；承担新闻发布工作；对行业贯彻执行国家和省市关于交通发展战略、方针、政策以及法律法规、规划计划的情况进行监督检查，及时反馈情况，提出建议，督促抓好落实；围绕交通运输中心任务和发展中的问题，组织调研，综合分析情况，提出对策或决策建议。

（二）政策法规科。承担机关重大决策等论证和有关规范性文件的合法性审核工作；承办相关行政执法、行政复议和行政应诉工作；负责政务公开工作；负责信用体系建设工作；负责行政执法双随机一公开监管工作；负责政策法规宣传、监督和行政执法教育管理；组织开展政策研究；指导公路、水路行业有关执法监督和体制改革。

（三）综合规划科（市交通战备办）。会同有关部门组织编制综合运输体系规划，承担有关协调工作；组织拟订公路、水路等行业发展战略和规划，参与拟订物流业发展战略和规划，提出有关政策和标准的建议；负责全市交通基础设施建设项目的计划安排和相关统计工作；承担有关规划和建设项目的相关工作；提出国家和省、市有关专项资金投资政策和资金安排提出建议；承担有关环境保护、利用外资、统计信息工作；负责执行上级有关国防交通战备工作的方针和指示；规划全市国防交通网络布局，对交通建设提出有关国防要求的建议；协调落实全市国防交通工程建设计划及全市国防应急交通保障计划；组织全市国防运力动员工作；制定、落实全市国防交通物资储备计划和战时征用计划，协调国防交通物资的调用工作；指导、监管全市国防交通工作。

（四）财务审计科。负责机关财务管理工作；贯彻落实公路、水路行业财务管理制度和办法，并监督实施；负责公路、水路等行业省、市投资项目资金拨付、使用监督、预决算工作；指导行业国有资产管理和财务会计工作；根据政府授权，对国家出资企业和国有权益履行出资人监管职责；负责行业内部审计和业务指导工作；组织实施对交通运输行业国有资产保值增值、重大财务收支和经济效益，省、市投资的交通建设项目，以及省、市交通专项资金使用及管理情况的审计或审计调查；组织实施对局直单位领导干部的经济责任审计；外部审计的协调配合及审计成果的应用工作。

（五）建设管理科。拟订公路、水路等交通运输基础设施建设相关管理办法，并监督实施；完善交通建设诚信体系，维护交通建设市场秩序；负责市管交通重点建设项目招投标监督工作；参与市管交通重点工程的竣工验收相关工作；负责全市“四好农村路”管理工作；负责市管交通重点建设项目农民工工资监管工作；组织调查处理交通运输基础设施重大质量事故；指导公路养护、路政管理和港口维护工作；负责公路、水路等交通基础设施建设的技术管理和指导工作；组织论证建设方案；审查重点建设项目的初步设计、施工图设计文件和重大设计变更；牵头处理工程建设中的重大技术问题以及公路建设管理，交通工作质量监督管理；负责公路、水路等行业科技、信息化政策的落实；组织协调交通运输重大科技项目研究，以及新科技成果转化和推广应用工作。

（六）运输管理科。承担公路、水路运输市场监管和城市客运监督管理工作，拟订相关办法、制度和标准并监督实施；组织协调重点物资运输、紧急客货运输工作；负责制定行业节能减排发展战略，并指导实施；按规定承担物流市场有关管理工作；负责落实水路交通运输基础设施建设相关政策和管理办法并监督实施；负责道路运输管理，海事（水运、港口）管理，渔船检验监督管理等职责。

（七）安全监督科。监督实施道路、水路安全生产政策和法规的落实并负责拟定应急预案；指导全市公路、水路、公共交通（含出租车）行业安全生产和应急管理工作；指导全市有关安全生产和应急处置体系建设；依法组织或参与有关事故调查处理工作。

（八）行政审批办公室。负责交通运输管理方面有关行政审批事项的受理和审批工作；负责行政审批企业信息归集工作；负责组织协调行政审批事项的勘查、论证、审查、审核和上报等相关工作；负责有关行政许可证的发放工作；负责行政审批专用章的使用管理；负责法律、法规、规章规定由交通运输部门承担的其他行政审批事项。

（九）机关党委。负责机关和所属单位的党群、人事、机构编制及信访工作；负责组织系统精神文明建设工作。