1986年，上海中医药大学附属曙光医院获得卫生部批准，成为首批中药临床药理基地。

1993年，该医院被评估为三级甲等中医院。

2001年，医院成为中国第一家通过iso9001质量管理体系认证的中医医院。

2010年，上海中医药大学附属曙光医院临床药理科和检验科通过了中国合格评定国家认可委员会的iso17025和iso15189认证。

2022年8月，经过上海市中医、中西医结合医院综合评价（评审）中心的评审和上海市卫生健康委、上海市中医药管理局的审核公示，上海中医药大学附属曙光医院通过了三级甲等中医医院的复评审。