基金会成立后，将依法募集社会资金，促进社会力量捐资办学用于民办教育的发展，弥补学费收入和政府投入的不足，同时充分发挥民办学校体制的灵活优势，推动捐赠制度的完善和捐赠文化的形成。

新成立的民办教育发展基金会，将发挥教育资金的“蓄水池”功能，积极筹集社会资源和资金，接受终止办学(退出办学)的民办学校形成的国有资产、社会资产、捐赠资产；发挥“孵化器”功能，资助公益性强、办学特色突出、符合社会需求的新创办的非营利性民办教育机构和中小幼民办教育机构。基金会还将资助民办学校教师教学科研和提高待遇，奖励为民办教育作出突出贡献的单位和个人。

基金会成立后，近期的资金主要用于首批6个项目，其中包括:实施民办高校教师发展的“同舟计划”，资助民办高校科研团队；实施民办中小学幼儿园教师发展“萌芽计划”，促进民办中小学教师的专业发展；实施民办学校学生社团“追梦行动”，资助有创新、实践性强、专业与人文素养提升结合紧密的学生社团项目；在今年奖励10位民办教育优秀突出贡献者、10位民办高校优秀辅导员等。