上海市复旦中学是所历史名校，与复旦大学同根同源。学校前身为中国著名教育家马相伯创办于1905年的复旦公学，百年历程中，先后经历了“复旦公学、复旦大学附属中学和复旦中学”三个历史发展阶段。孙中山先生曾担任学校首席校董，严复、于佑任、邵力子等著名学者和政治家是复旦中学的创校先贤。多年来，复旦中学为国家培养了一大批文化名人、名师及十多位院士，输送了数以万计的国家有用之材。

2013年，上海市教委专家组评审并通过了复旦中学创建“上海市实验性示范性高中”的规划。

2005年百年校庆之际，复旦中学发起成立第一届复旦基础教育论坛，复旦中学担任理事长单位，复旦大学担任顾问单位。在同一面旗帜下，遵循一个校训，咏唱一首校歌的上海市复旦中学、复旦大学附属中学、重庆复旦中学和台湾复旦中学等4所学校成为第一届论坛理事单位，共同传承复旦文化与精神。论坛产生了深远的历史影响：凝聚了复旦旗帜下的基础教育学校，辐射了复旦品牌的影响力，提升了复旦基础教育的内涵。

2010年，在大学领导下，“复旦基础教育论坛”发展为“复旦基础教育联盟”，复旦大学在学校文化建设、课程建设、师资队伍建设、图书馆建设、实验室建设等方面与复旦中学互联互通，支持复旦中学的发展。

2010年3月，复旦中学被上海市教委列为首批“创新素养培育项目”实验学校，开展以“课程·课堂·践行”为主线的实践探索，初步形成了以“文化主题轴综合课程”为核心的博雅课程序列，“博思学子讲堂”与“相辉文化讲谈”渐成学校教育教学的两大载体。