1984年，上海交通大学应用化学系成立了生物科学与技术研究所，并招收分子生物学专业研究生，后发展为上海交通大学生物科学与技术系。

1997年2月，上海交通大学生命科学技术学院在原生物科学与技术系与生物医学工程教研室的基础上，由上海交通大学与中国科学院上海分院联合建立。

2011年4月，生物医学工程系分出成立上海交通大学生物医学工程学院。

2016年，在第四轮全国一级学科评估中，生物学跻身第一方阵。

2017年，生物学被列入国家“双一流”建设学科名单，生物工程一级学科博士点新获批建设。

2018年，学院荣获首批全国党建工作标杆院系培育创建单位。

参考资料：