1985年，上海交通大学建立社会科学及工程系和文学艺术系。

1997年，上海交通大学在社会科学及工程系和文学艺术系基础上，成立人文社会科学学院。

2003年，以文、史、哲、艺为主干学科的上海交通大学人文学院成立。

2015年5月12日，学院与国际教育学院合并为新的上海交通大学人文学院。9月17日，学院成立上海交通大学世界反法西斯战争研究中心。12月25日，学院成立中国作家协会-上海交通大学当代中国文学与文化研究基地。

2019年，上海交通大学人文艺术研究院并入上海交通大学人文学院。