博物馆设置11个主题展厅：

科举功名厅：展示科举制度演变及历史文物

朱子家训厅：陈列朱熹家训文献及相关文物

非遗传承厅：聚焦非物质文化遗产保护成果

近代试卷展：收藏晚清至民国时期考试文献

临渝教育史：系统梳理山海关地区教育发展脉络

上山下乡知青展：纪录知青运动历史文物

其他专题展厅还包括祝寿厅、文化交流厅、兴儒厅、金石篆刻厅、名人书画厅等，总展陈面积合计2500平方米。