1975年，学校前身山东省烟台粮食学校创建。

2003年2月，更名为“山东省商务科技学校”；4月，经山东省教育厅批准，以山东省商务科技学校为基础筹建山东商务职业学院。

2006年2月，学校独立升格为普通高校，更名为山东商务职业学院。

2013年，被列为山东省技能型人才培养特色名校立项建设单位。

2015年9月，原山东省粮食干部学校并入，成为山东商务职业学院济南校区。

2021年9月30日，通过中华人民共和国教育部现代学徒制第三批试点验收。

2022年，学校共在山东省内录取新生5374人。

2023年12月19日，学校烟台市校地融合项目-非物质文化遗产创新创业综合管理展示平台建设竞争性磋商公告。