学校前身

2005年-2010年，潍坊陆洋运输有限公司、潍坊交运集团有限公司、山东通达国际船舶管理有限公司分别创办了潍坊华洋船员培训基地、潍坊海运职业中等专业学校、潍坊通达国际航运学校，三所职业院校属于民办职业院校，是山东海事职业学院的前身。2005年，潍坊华洋船员培训基地改为潍坊华洋水运学校。

合并升格

2011年5月，经教育部备案，以山东华洋航海专修学院和潍坊海运专修学院为基础组建山东海事职业学院。7月25日，由潍坊市政府、潍坊陆洋运输有限公司、潍坊交通运输集团有限公司和山东通达国际船舶管理有限公司经过商议，采取股份制的方式，共同出资举办山东海事职业学院。

2013年，潍坊市政府委托第三方评估机构对山东海事职业学院的办学资产进行评估，明确了出资者的股份：潍坊市金融控股集团占1·47%、潍坊交运集团有限公司占67·79%、潍坊陆洋运输公司占15·37%、山东通达国际船舶管理有限公司占15·37%，学校法人享有法人财产权。

2014年，学校首获单独招生试点。

2016年，山东海事职业学院成为职业院校混合所有制改革办学实践试点单位。

2017年7月12日，山东海事职业学院被确定为山东省第二批教育信息化试点单位。

2018年，山东海事职业学院在山东省民政厅注册为民办事业单位法人，属于非营利性民办学校。1月，山东海事职业学院牵头组建了全国职业教育混合所有制办学研究联盟，并当选理事长和秘书长单位。先后在山东潍坊、贵州六盘水、新疆乌鲁木齐、浙江台州等地组织召开七届全国职业教育混合所有制研究联盟办学研讨会。10月，山东海事职业学院公布《山东海事职业学院优质高校建设方案》，提出积极推进全国首所混合所有制应用型本科高校——山东海洋技术大学的筹建进度。

2019年3月，学院向教育厅提交招收和培养国际留学生备案的请示并获得批准。

2020年7月，山东海事职业学院在教育部第三批“1+x”证书制度审批工作中，申报的10个“1+x”证书全部获批，正式成为“1+x”证书制度试点院校。9月17日，《潍坊市人民政府山东省教育厅共建山东省职业教育创新发展示范区实施方案》正式印发，提出创建山东海洋技术大学，根据教育部设学政策，支持山东海事职业学院升格为本科层次职业技术大学。

2021年，山东海事职业学院分别承办教育部教育发展研究中心主办的“职业教育校企合作办学研讨会”和教育部职业教育与成人教育司主办的“全国职业教育混合所有制股份制办学研讨会”。3月2日，经潍坊滨海经济技术开发区管委会同意，山东海事职业学院与山东海洋技术大学（筹设中）合并，共同申办本科大学。

2022年11月，中华人民共和国海事局颁发《关于公布山东海事职业学院开展海上设施工作人员海上交通安全技能培训的通知》，山东海事职业学院获批“海上设施工作人员海上交通安全技能培训”资质，获批规模为20人/班×2、专业培训规模为20人/班×2。