（一）办公室

负责文电、会务、宣传、机要、档案、人事、机构编制、财务、固定资产管理、政务公开、督查督办、安全、保密、信访和后勤保障工作；负责人大代表建议和政协委员提案的分办工作。

（二）奖励宣传与政策法规科

负责贯彻落实科技（知识产权）政策法规相关工作；草拟全市科学技术（知识产权）方面的政策和制度；拟订全市科技奖励、科技成果评价、科技成果登记、科技保密、技术市场等方面的政策措施和管理办法，并组织实施；协助做好科技进步考核工作；负责做好科技人才队伍建设工作；组织开展软科学研究。

（三）计划与统计科

拟订全市科技发展规划及编制实施年度计划；拟订促进科技中介组织发展政策；负责科技计划保密和涉密项目管理；组织有关科技项目评估管理和科技统计。

（四）工业与高新技术发展科

拟订有关高新技术发展及产业化的规划和政策；负责科技创新平台建设认定和运行管理工作；推动工业领域科技创新改革；负责工业领域科技项目的申报管理工作；承担高新技术企业、创新型试点企业、科技小巨人企业等的审查推荐工作。

（五）科技合作科

拟订国内科技合作的发展规划、政策以及对外交流与合作的政策制度；编制并组织实施国内科技合作年度计划；承担政府间及国际组织间科技交流与合作、科技入滇、沪滇科技对口帮扶事宜；承担与高等院校、科研机构科技合作的有关工作；提出促进民营科技和非公经济发展的建议；承担院士专家工作站、科技型中小企业等的审查推荐工作。

（六）农村科技科

拟订科技促进农村发展的规划和政策，编制并组织实施农业农村科技研究发展计划，推动农村科技进步；推动农业领域科技创新改革；负责农业领域科技项目的申报管理工作；促进农业领域有关重大科技成果应用示范；承担农业科技型企业、农业科技园区、农村经济合作组织等的审查推荐工作。

（七）社会发展科技科

拟订社会发展领域科技发展规划和政策；编制并组织实施有关领域高新技术研究发展计划；推动社会领域科技创新改革；负责社会领域科技项目的申报管理工作；促进社会领域有关重大科技成果应用示范；承担国家可持续发展实验区、云药之乡、中药材种植示范园等的审查推荐工作。

（八）知识产权科

拟订专利发展规划和计划并组织实施；指导企业及有关部门做好专利工作，拟订和组织实施专利信息网络发展规划;负责知识产权宣传、教育及培训等工作；协调研究知识产权事业发展战略和有关知识产权方面的重大问题；协调处理涉外知识产权事宜；开展专利执法，依法处理专利纠纷和查处假冒专利行为等。