盘古开天辟地，力竭而亡。清气升，为天；浊气降，为地，清阳上升，形成天界；浊元下降，形成阴间和地狱；中为人间，共称三界。世界万物轮回，形成六道。但世人不知，世间另有一个大轮回，一旦大轮回发生，一切都将重新排列组合。彼时，天界可成阴间，地狱可成天界，火亦可冷，冰亦可热，做善事亦可受罚，一切都可颠倒。只有寻得盘古元神，方可阻止这场大轮回。后来功德圆满的孙悟空成为斗战胜佛。他得知元神秘密后，将附有盘古元神的金箍棒封存在太上老君八卦炉中，以三昧真火炼化为神灯，镇于瑶池深处。 灯芯为神火灼烧，竟炼化出灵性，修成人形，游戏瑶池间，被守护神灯的巨灵神发现。为搪塞身份，灯芯自称王母身边的掌灯侍女——小倩。巨灵神与小倩一见钟情。后巨灵神违背天条，擅自私带侍女离开瑶池，为玉帝发现，将灯芯打回原形，欲重新封入瑶池禁地。巨灵神为救爱人起兵造反却被二郎神所败，打下凡间为妖。神灯亦于争斗间失落，化为元神珠，坠入人界。西方摩伽陀国有高僧善无畏，受佛祖点化，于玄宗开元四年时，长途跋涉至长安，并凭自己高深的悟性觅得元神珠。善无畏趁元神威力减弱的机会修兰若寺，期望永久的封印盘古元神。后兰若寺荒废，封印松动，元神之力渐渐溢出，而灯芯一灵不昧，趁此时机逸出兰若，但因受封印之力所困，已丧失前世记忆，更须历十世轮回之苦。

千年光阴，十世流转，已至明末。因鬼界与天界之争打破清浊平衡，人界旱涝灾害不断，多地饥荒，妖物也自山林地穴涌入人间，生灵涂炭。兰若寺的秘密，并非如高僧所愿那般湮没。姥姥就是其中极有野心的一个知情者。一次黄泉路上，姥姥遇到已历十世情劫，为情而逝的亡魂小倩，以答应让她与爱人重逢为饵，将小倩招至麾下，为其所用。兰若寺不远处，阴暗的洞穴中有黑风魔王，为巨灵神下届所化。黑风魔王和天宫之间有着难以化解的仇恨，亦是玉帝的隐患。而小倩所受的天谴和他要寻得小倩的执念，令他的怒火愈燃愈烈。三界之乱，皆因元神而起。只有再度寻回并封印元神珠，方可平息这一切风波。当此世，娑婆众生，岌岌可危。玩家需加入到这场英雄救世的故事中。游戏故事，自此开始。

盘古元神之力渐难以压制，随着越来越多的人飞升至天庭，小倩身世的秘密也被揭开——她本为盘古元神的灯芯。此时姥姥和黑山老妖正围攻天宫，三界岌岌可危，大战一触即发，魔气肆虐在三界的每个角落。

小倩面临艰难的抉择，她既对三界慈悲为怀，又对宁采臣恋恋不舍。最终，小倩为拯救三界，平息争端，决心将自己封印回瑶池禁地中。虽对小倩十分怜惜，但众人只得接受小倩选择的这一结局。小倩希望宁采臣以及众人都忘记她，只说想她时就点一盏花灯。

小倩封印自己那一瞬间落下的泪，令三界为之震动。小倩消弭不见，金陵和杭州降下花雨。

正当大家惶惶不安时，宁采臣用颤抖的手点燃了一盏灯，然后大家纷纷点燃了手中的灯，照亮了人世间。但当大家再次看清这个世界时，却发现整个三界都不同了，蒲家村、金陵、杭州都不同了。

而三界中的众生们，仿似忘却了小倩这个名字，更不知晓三界几乎毁于浩劫之中，一切似乎从未发生过。家家户户张灯结彩，庆祝夏灯节。这样的平静和祥和，不正是小倩选择的初衷吗？

世间万物，从头开始。玩家需要捞起河灯，点亮灯中世界，与阿初、蒲松龄、哮天犬一起开启新的冒险之旅。