青 岛农业大学图书馆下设办公室、文献采编部、图书借阅部、期刊阅览部、参考咨询部、数字资源部、现代技术部、文科馆借阅部、莱阳馆借阅部等工作机构，各部室的主要职能如下：

馆长：负责全馆行政和业务工作的组织领导、管理协调等工作。

综合办公室：负责全馆行政工作、统计工作、档案管理、来访接待及各部门之间的协调等工作。

文献采编部：负责各类文献的采访、分类、编目、加工、典藏等工作。

图书借阅部：负责自科图书的收藏保管、流通借阅、修补剔旧、借阅证管理等工作。

期刊阅览部：负责报刊的分类、编目、加工及阅览室管理等工作。

参考咨询部：负责信息咨询、文献课教学、信息检索等工作。

数字资源部：负责数字资源的建设和管理等工作。

现代技术部：负责图书馆自动化建设、馆内计算机软硬件管理和维护、数字资源阅览室管理等工作。

文科馆借阅部：负责社科图书的收藏保管、流通借阅、修补剔旧等工作。

莱阳馆借阅部:负责莱阳馆藏图书的收藏保管、流通借阅、修补剔旧、借阅证管理等工作。