截至2024年5月，上海海事大学有临港校区、港湾校区和民生路高恒大厦3个校区。其中，临港校区是目前学校办学主体所在地，于2008年10月基本建成，校园占地面积133万余平方米，总建筑面积60万平方米。

临港校区

临港校区位于上海市浦东新区南汇新城镇海港大道1550号，临港校区是目前学校办学主体所在地，主要有物流科学与工程研究院、商船学院、物流工程学院、信息工程学院、法学院、经济管理学院、文理学院、徐悲鸿艺术学院、中荷机电工程学院、海洋科学与工程学院、外国语学院、交通运输学院、亚洲邮轮学院、马克思主义学院。

上海海事大学临港校区

港湾校区

港湾校区位于上海市浦东新区浦东大道2600号，港湾校区是学校继续教育、中等职业教育主要办学地。

上海海事大学港湾校区

民生路高恒大厦

民生路高恒大厦位于上海市浦东大道1608号 ，总建筑面积33573·87㎡。