网上值机

2014年11月起，南通兴东国际机场官方网站开通网上值机服务，旅客可以在南通机场官网首页点击“网上值机” ，进入办理值机页面，输入身份证号或者13位机票号即可办理登记手续。如果无需托运行李，通过网上办理登机手续提前预订座位并将登机牌打印出来，可直接通过安检登机，无需到机场服务柜台排队办理登机牌。

无纸化登机

2018年9月1日起，凡从南通兴东国际机场乘坐中国国内航班、非中转联程、12周岁以上且不需要托运行李的旅客，旅客无需在柜台排队等候值机，可直接到安检柜台向安检员出示个人有效身份证件及二维码电子登机牌，进行安全检查。通过安检验证后，领取加盖安检验讫章的热敏纸登机凭证。旅客凭热敏纸登机牌完成登机口验证及舱门二次复核。