仙林校区

南京师范大学仙林校区位于南京市栖霞区文苑路1号。校区设有公共管理学院、法学院、商学院、数学科学学院、物理科学与技术学院、化学与材料科学学院、体育科学学院、美术学院、马克思主义学院、生命科学学院、地理科学学院、环境学院、文学院、计算机科学与技术学院等学院。仙林校区拥有学正楼、学明楼、学海楼、学行楼、敬文图书馆、行健楼、行敏楼、厚生楼、笃学楼、化成楼等建筑设施。

随园校区

南京师范大学随园校区位于南京市鼓楼区宁海路122号。校区设有文学院、新闻与传播学院、商学院、教育科学学院、外国语学院、社会发展学院、音乐学院、金陵女子学院、教师教育学院、国际文化教育学院、心理学院等学院。

随园的历史，可以追溯到曹雪芹的祖父曹寅，他于清凉山附近建造了这座当时江南最大的园林，据说，这也是《红楼梦》中大观园的原型。在几经转手后，它由大诗人袁枚命名并沿用至今。建成时，校园中有六幢宫殿式的建筑，它们分别是会议楼（100号楼）、科学馆（200号楼）、文学馆（300号楼）及三幢学生宿舍（400号楼、500号楼、600号楼）。1924年，又建成了一幢学生宿舍（700号楼）。1934年，建成了图书馆和大礼堂。2023年12月，南京师范大学博物馆在随园校区内揭牌成立。

紫金校区

南京师范大学紫金校区位于南京市玄武区板仓街78号。校区设有南瑞电气与自动化学院、能源与机械工程学院等学院。紫金校区拥有第一教学楼，第二教学楼，第三教学楼，动力实验中心，图书馆，综合楼，图书馆等建筑。