学校前身

内蒙古财经学院

1954年，内蒙古自治区工业干部学校创建。

1960年，内蒙古财经学校、内蒙古自治区工业干部学校、内蒙古自治区商业干部学校、内蒙古自治区财政干部训练班合并组建内蒙古财经学院。

1962年，内蒙古商业学校、内蒙古财政金融学校并入内蒙古财经学院。学院改建内蒙古财贸干部进修学院。

1965年，内蒙古财贸干部进修学院改建内蒙古财贸学校。

1980年，内蒙古财经学院复建。

1983年，内蒙古管理干部学院创建。

1986年，内蒙古经济管理干部学院创建。

2000年，内蒙古自治区管理干部学院并入内蒙古财经学院。

2005年，学校获得硕士学位授予权。

内蒙古财税职业学院

1979年3月，内蒙古自治区政府正式批准由内蒙古财政局、建设银行、税务局和物资局四个部门筹资建设内蒙古财政会计学校，为四个部门培养财经类中等专业人才。

1986年6月，自治区人民政府批准在内蒙古财政学校基础上成立内蒙古税务学校。学校发展为两块牌子、一套机构的两校一体的办学体制（简称“内蒙古财政、税务学校”）。

1993年7月，内蒙古自治区人民政府确定内蒙古财政、税务学校为省部级重点普通中等专业学校。

2000年4月，经国家教育部验收批准，确定内蒙古财政、税务学校为国家级重点普通中等专业学校。

合并发展

2006年1月，原内蒙古财税职业学院和原内蒙古工商学校并入内蒙古财经学院，内蒙古财税职业学院改建为“内蒙古财经学院职业学院”。同年，学校通过国家教育部本科教学工作水平评估。

2009年，学校正式获批成为工商管理硕士专业（mba）学位研究生培养单位。

2012年3月19日，内蒙古财经学院更名为内蒙古财经大学。

2013年5月，被教育部评为全国毕业生就业典型经验高校。

2016年8月，学校入选数据中国“百校工程”产教融合创新先行先试合作院校项目。

2017年3月，学校与蒙古国高校签约成立中蒙联合国际大学；同年7月，学校入选2017年度全国创新创业典型经验高校。

2019年6月，祖国北疆资源利用与环境保护协调发展院士专家工作站在内蒙古财经大学揭牌。

2020年，学校建校60周年。

2021年12月25日，内蒙古大学、内蒙古工业大学、内蒙古财经大学三所高校联合培养马克思主义理论一级学科博士点研讨会成功召开，标志着三所高校联合建设马克思主义理论一级学科博士点工作正式启动。

2022年8月，发起成立高校数字化发展与创新联盟。

2025年3月，内蒙古财经大学与阿拉善盟签署战略合作框架协议。

2025年4月9日，民进内蒙古财经大学支部正式成立。