前身回眸

南京审计学院

1983年8月，江苏省人民政府正式批复南京市人民政府，同意筹办南京财贸学院。同年9月，学校筹备组委托金陵职业大学代招165名新生，借南京市财贸干校校舍（地址为香铺营）上课。

1984年8月，南京财贸学院迁至凤凰西街。

1987年5月，学校改由国家审计署与南京市人民政府联合办学，与江苏省教委共同管理，同时更名为南京审计学院。同年6月，学校审计系正式成立。

1990年12月，学校改为审计署直属高等院校，实行审计署、江苏省和南京市共同领导，以审计署为主的领导体制。

1993年2月，经国家教委批准，学校改建为本科院校，仍实行由审计署和江苏省人民政府双重领导，以审计署为主的领导管理体制。

1998年4月6日，学校首届英国特许公认会计师公会（acca）项目班开班。同年11月，学校成立“acca（英国特许公认会计师公会）培训中心”及“acca南京考试中心”。

1999年11月，学校通过教育部全国高校本科教学工作合格评估。

2000年2月，学校划转为江苏省教委直属高校，办学管理体制调整为省署共建，以江苏省管理为主。

南京金融高等专科学校

1951年，中国人民银行苏北区分行初级银行学校于扬州市北河桥畔设立。

1952年8月，学校更名为中国人民银行华东区行银行学校，办学地址迁往苏州市乔司空巷。

1953年1月，学校更名为中国人民银行江苏省银行学校；同年7月，更名为中国人民银行苏州银行学校。

1954年10月，学校更名为中国人民银行上海银行学校，办学地址迁至上海市马玉山路。

1956年，学校恢复中国人民银行苏州银行学校校名，办学地址复为苏州市乔司空巷。

1958年，学校更名为苏州地区财经专科学校。

1965年3月，学校更名为江苏银行学校，办学地址改为苏州市浒墅关镇。

1970年，学校停止办学。

1978 年12月，江苏银行学校于淮阴市恢复办学并扩建。

1979年，学校迁至南京市江浦县珠江镇。

1984年，学校筹建江苏金融专科学校。

1985年7月，学校更名为南京金融专科学校。

合并建新

2002年4月，南京金融高等专科学校并入，组建新的南京审计学院。

2003年，学院新校区征地获批准，选址于南京市浦口区珠江镇，总规模为75公顷，建筑面积40万平方米。同年11月，学校成为联合培养硕士学位研究生单位，与南京大学联合培养硕士学位研究生，首批招收会计学、国民经济学硕士研究生25名。

2005年2月，学校举行新校区开工奠基仪式。同年6月，教育部批准南京审计学院金审学院由二级学院转制为独立学院。同年10月，学生入住新校区新建校舍。

2006年6月，学校召开第二次党代会，确立了到2020年把学校建成国内外有重要影响的特色名校的战略目标。

2007年，学校在教育部本科教学工作水平评估中获得优秀。学校会计学、国民经济学、金融学、行政管理、政治经济学、法学理论和企业管理共7个学科被评为江苏省重点建设学科。

2010年4月，学校被批准为新增硕士学位授予立项建设单位。

2011年8月，学校成为“三部一省”即教育部、财政部、审计署、江苏省人民政府共建高校。同年10月，学校被国务院学位委员会批准成为全国首批审计硕士专业学位授权单位。

2012年3月29日，审计署审计干部教育学院在学校开工奠基，被评为首批“江苏省教学工作先进高校”。同年9月，学校独立招收的首批研究生——55名审计硕士专业学位研究生入校。

2013年7月，学校被批准为硕士学位（学术学位）授予单位。

2014年，学校获批为金融、会计专业硕士研究生培养单位。同年3月，学校设立书院。同年10月，学校与先锋书局共建的浚园“先锋润泽书局”正式开业。

2015年10月26日，教育部同意南京审计学院更名为南京审计大学。同年12月12日，学校正式启用新校名“南京审计大学”。

2016年3月，学校编制出台《南京审计大学“十三五”教育事业发展规划纲要》，配套制定了《南京审计大学“十三五”学科建设规划》《南京审计大学“十三五”专业建设规划》《南京审计大学“十三五”师资队伍建设规划》等5个专项规划。

2018年7月1日，江苏省首家监察学院在南京审计大学正式成立，即南京审计大学监察学院。同年8月，中央军委审计署与学校签署战略框架协议。

2020年12月26日，学校加入长三角高水平行业特色大学联盟。

2021年4月24日，南京审计大学发起成立全国审计学专业教育联盟；10月26日，学校获批博士学位授予单位与统计学一级学科博士学位授权点（需要加强建设）。

2022年，学校通过验收，正式成为博士学位授予单位。同年6月22日，学校成立南京审计大学心理健康教育教学部。同年12月9日，学校参与共同组建的长三角新商科教育联盟成立。

2023年5月，南京审计大学联合研究院正式成立。同年7月4日，中共中央总书记、国家主席习近平给南京审计大学审计专业硕士国际班的留学生回信。

2025年3月20日，南京审计大学与江北公用集团举办校企合作签约暨产学研合作基地揭牌仪式。同年4月10日，呼伦贝尔市审计局与南京审计大学举行战略合作签约授牌仪式。