学校前身

1953年4月，江苏省交通厅开办江苏省交通厅干部职工培训班，分类举办干部训练班、国营内河轮船公司工人训练班、省汽车驾驶训练班。

1956年初，学校在合并三个训练班基础上，定名为“江苏省交通干部学校”，总部设在建邺路26号，并在此基础上批准筹备“江苏省（中等技术）交通学校。

1965年6月，经江苏省人民政府批准，江苏省交通厅以“南京汽车职业学校”和“南京航运职业学校”为基础，组建“江苏省南京交通学校”。学校为中专性质，参加全省统一招生，开设水运调度、陆运调度、计划统计、财会4个专业，招收新生204人。

1969—1972年，因“文化大革命”，学校停办。

1973年1月，江苏省革委会批准南京交通学校复办招生，学校性质确定为中等专业学校，毕业生待遇亦按中专毕业生待遇处理。学校在南京农业机械化学校借址恢复办学，10月，学校录取新生（工农兵学员）132名。

1982年， 经省计委批准，学校重新选址办学；同年9月，学校搬入浦口校区（南京市浦口区东门后河沿90号）。

1987年，根据国家对中专校招生对象逐步过渡到初中生的相关规定，学校开始由招收高中毕业生改为初中毕业生，学制为四年，当年招收4个班。江苏省人民政府批准学校在校生规模扩大为1500人。

1992—1993年，学校先后取得办学条件评估a级、办学水平评估a等次，被评为交通部规范化普通中等专业学校、省部级重点中等专业学校。

1994年10月，学校被评为国家级重点普通中等专业学校。

正式成立

2001年6月19日，经江苏省人民政府批复，学校独立升格为南京交通职业技术学院。同年，被中共江苏省委、省政府授予“江苏省文明单位标兵”称号。

2002年，学校在南京江宁大学城征地850亩建设新校区。

2005年10月，学校顺利搬迁至江宁新校区；12月，学校以“优秀”等次顺利通过了教育部高职高专院校人才培养工作水平评估。

2008年7月，学校被江苏省教育厅、财政厅确定为“江苏省示范性高等职业院校建设单位”。

2010年5月，学校牵头组建“江苏交通运输职业教育集团”，被推选为理事长单位。同年，学校第一个省级工程研发中心——“江苏省道路交通节能减排工程技术研究开发中心”经省交通运输厅、教育厅批准正式成立。12月，学校获得“2007—2009年江苏省文明单位”荣誉称号。

2011年6月，江苏省高等教育体制改革的试点项目，“南京交通高职教育联合体”在学校正式启动。12月，学校通过教育部新一轮高职院校人才培养工作评估。

2012年5月，学校被江苏省教育厅授予“2012年度江苏省高校毕业生就业工作先进集体”称号。8月，学校被江苏省人民政府授予“高技能人才摇篮奖”。10月，学校被江苏省教育厅评为“2012年江苏省教学工作先进高校”。

2013年，经省教育厅批准，学校自主单独招生专业为汽车检测与维修技术、道路桥梁工程技术、物流管理、通信技术、建筑工程技术、建筑装饰工程技术六个专业。

2014年，学校被评为“2012-2013年度江苏省高等学校和谐校园”。同年，交通节能减排中心获批设立博士后科研工作站。

2015年，学校交通节能减排中心与河海大学签署研究生培养基地协议。

2016年，经省教育厅批准，南京工程学院与南京交院自2016年起试点土木工程专业（交通土建方向）“高职与普通本科联合培养”工作。同年，学校交通节能减排中心分别与南京大学、东南大学合作申报的研究生工作站成功获批。

2017年6月21日，南京交通职业技术学院轨道交通学院成立。

2018年1月30日，学校入选江苏省高水平高等职业院校建设单位。

2019年，学校获江苏省五一劳动奖状、南京市五一劳动奖状荣誉称号；同年，学校获批为国家自然科学基金依托单位。

2021年，学校申报的“江苏省交通节能减排工程研究中心”被认定为江苏省工程研究中心。