南京工业大学目前分为江浦校区、丁家桥校区和虹桥校区共三个校区。

江浦校区（本部）

校区地址是江苏省南京市浦口区浦珠南路30号，位于浦口区珠江镇东，面朝长江，背靠老山森林公园，东邻珍珠泉，西接南京审计大学、南京海军指挥学院，东南与市区隔江相对。校区总面积3600亩，形状狭长，南北长2220米，东西宽920米，环境宜人，交通便捷。截至2018年校区内的逸夫图书馆占地面积约38000平方米，藏书量达到120万册。

丁家桥校区

校区位于江苏省南京市鼓楼区新模范马路5号。

虹桥校区

校区位于江苏省南京市鼓楼区中山北路200号。