获得全国红十字先进集体、全国卫生系统先进集体、全国巾帼建功先进集体、江苏省文明单位、江苏省健康促进医院优秀单位、省首批平安医院，南通市文明单位、信得过医院等荣誉称号。

2025年3月24日，人力资源社会保障部、国家卫生健康委、国家中医药局、国家疾控局发布《人力资源社会保障部 国家卫生健康委 国家中医药局 国家疾控局关于表彰全国卫生健康系统先进集体、先进工作者及“白求恩奖章”获得者的决定》，其中，南通市第一人民医院入选全国卫生健康系统先进集体表彰名单。

2025年5月，入选第七届全国文明单位名单。