第一阶段：初创期

重点建设南京理工大学科技园。

主要任务：研究大学科技园的发展战略，明确目标与定位；编制科技园建设与发展总体规划和基本建设规划；基本完成南京理工大学科技园孵化器建设；研究探索科技园的管理体制和运行机制；初步形成基础设施与房地产开发、创业与风险投资、技术创新孵育服务、企业经营、商贸、金融、咨询、中介、生活后勤服务、人才培训与交流服务等综合服务体系；完成创新园、服务园区建设。

基本目标：建设10万平方米的孵化场地及附属设施； 在孵企业达到100个；优势学科的重点实验室和工程研究中心导入孵化器；入园产业化项目20个；园区技工贸年总收入突破10亿元。

第二阶段：发展期

在与南京理工大学合作向更高层次发展的同时，积极寻求与南京航空航天大学、解放军理工大学等区内其他高校和研究所合作，再建设几个新的孵化器。

主要任务：推动发展模式从“一校一园”向“多校一园”转化，建成布局合理的多个孵化器，形成孵化分散、产业集中、专业细分的发展格局；积极探索服务体系规范化、市场化、专业化连锁经营的模式；资本运作力求有所突破；产业化基地建设与开发形成2500亩左右的规模。

基本目标：孵化场地及附属设施达30万平方米；在孵企业达到300个；入园产业化项目达到100个；园区技工贸年总收入达到50亿元，利税10亿元；力争科技园内有2-3个企业上市融资。

第三阶段：成熟期

主要任务：孵化器建设向专业化、国际化方向发展；积极寻求与国际资本的融合和交流；科技园区技术创新、产业布局、人才汇集、综合服务、生态环境达到国内一流水平。

基本目标：孵化场地及附属设施达50万平方米；专业化孵化器不少于10个；在孵企业达到500个；产业化项目达到200个；园区技工贸年总收入达到100 亿元，利税20亿元；园区内多家企业在海内外上市。