南京住房公积金管理中心是负责南京地区住房公积金管理运作的职能部门。自2003年7月成立以来，中心坚持以科学发展观为统领，扎实践行“以人为本、执政为民”宗旨，服务大局，开拓进取，不断推进全市公积金制度和住房保障事业全面、协调、可持续发展，连续多年超额完成市政府下达的各项目标任务，不断扩大住房公积金制度覆盖面，强有力地支持了全市职工改善住房条件。截至2011年12月30日，全市累计归集住房公积金638·77亿元，发放贷款464·41亿元，支持26·21万户家庭住房消费，向市政府上交7·35亿元廉租房建设资金，保障5000多户低收入住房困难家庭，为全市推进 “住有所居”目标实现，以及率先基本实现现代化和建设现代化国际性人绿都做出了重要贡献。

南京市住房公积金管理中心二楼设置了公积金服务大厅，工行、农行、中行、建行、交行、中信、南京银行、浦发、招商、兴业、光大、华夏、民生、深发展、江苏银行、广发、紫金农商银行等17家银行及公证、抵押、担保公司等单位在服务大厅设立了业务办理点，使群众进入大厅就可以办完所有公积金业务，服务条件大为改善，让群众得到更为高效、便捷的服务。