中国南方航空的业务最早可追溯至1950年（庚寅年）5月，中国民航局在广州设立南航的前身——军委民航广州办事处，并于1959年1月正式成立民航广州管理局，负责中南五省（广东、广西、湖南、湖北、河南）的航空客货销售。

1969年，民航广州管理局组建运输服务队，开始管理及调配自己的机队。在改革开放前，一直实施半军事化管理。

1984年，中国民航局进行重组，将其业务部门分拆为4个主要的航空公司，其中民航广州管理局下辖“中国南方航空公司”，并于1991年2月1日正式挂牌成立，作为民航广州管理局在进行业务经营活动时对外使用的名称。期间公司逐渐开展了对外交流及拓展业务。

1990年，南航与香港和记黄埔、美国洛克希德共同组建了“广州飞机维修工程有限公司”（gameco）；至1991年，南航共有38架波音飞机飞往90个国内航点及12个国际航点，年发送旅客量达600万人次。

1992年12月20日，中国民用航空局实施体制改革，中国南方航空公司与民航广州管理局正式分开，成为自主经营、自负盈亏的经济实体，直属中国民用航空局。原民航广州管理局改为民航中南管理局，不再进行民航的经营业务活动，仅从政策上对其进行监督与管理。

1993年1月，中国南方航空公司被国家批准更名为“中国南方航空（集团）公司”，并以公司为核心企业组建中国南方航空集团。同年，南航还与波音签署了订购6架波音777客机的订单，包括4架777-200型及2架777-200er型。

南航的首架波音777于1995年12月28日交付使用，这也使其成为亚洲拥有此机型的运营商。其首个洲际航线为广州经北京至阿姆斯特丹，于1996年正式开办 。

1997年，南航又开设了一条越太平洋的洲际航线：广州至洛杉矶，班号为cz327的去程航线亦是南航迄今航程最远的航线，也因此成为航空史上首个以波音777进行横跨太平洋的双发延程飞行的航空公司。

为了适应快速发展的的需求，中国南方航空开始进入资本市场，以优化其财务结构。1997年7月，公司成功在纽约及香港的证券交易所同步上市，募得超过7亿美元的资金。公司随后于2003年也在上海证券交易所上市。

2000年7月，中国民用航空局宣布，其直接管理的10家航空公司将整合为中国三大航空集团：中国国际航空、中国东方航空和中国南方航空。8月4日，南航率先收购中原航空；次年又先后并入新疆航空、中国北方航空及其下属北亚航空和天鹅航空的国内业务。此外，南航还先后增持了中国众多航空公司的股票，为厦门航空（51%）及重庆航空（60%）的控股公司，并且是四川航空（39%）的股东之一。

2003年9月29日，南航向空中客车订购了4架a330-200系列客机，这是中国航空器材集团公司于同年4月签署的的30架飞机订单的一部分。首架飞机于2005年2月28日交付，从而使南航成为中国大陆首家a330的运营商。而就在此前的1月28日，南航又与空中客车签署了订购5架a380-800型飞机的订单，这也是该机型从中国获得的首份订单，并计划于2008年北京奥运会期间投入使用。首架南航a380已在2011年抵达广州，被波音正式命名为波音787的7e7系列则仍未有确切的交付时间。

2005年1月29日上午8时正，搭载234名台商的南航cz3097班机由广州白云国际机场起飞，并于9时20分首先降落台北中正国际机场，成为1949年中国内战结束后首架合法降落台湾的中国大陆飞机。

2006年10月19日，南航向波音订购了6架波音777货机，以支持跨太平洋航线运营的增长需求。首架飞机已于2009年12月3日交付，南航成为中国内地首家、全球第四家运营该机型的航空公司。同年12月30日，中国南方航空开通由北京经迪拜至尼日利亚拉各斯的航班，是东亚首条定期往来西非国家的客运航班。该航线曾受全球金融危机和国际油价大幅波动的影响而停航，但在2009年4月11日成功复航。

2007年9月6日，南航宣布其向波音增购了55架新一代b737-700和b737-800以扩大其机队规模。这些飞机将在2011年5月至2013年10月间交付。届时南航将可能成为世界上最大的波音737运营商。10月23日，南航又与空中客车就购买10架a330-200飞机签订合同，后者将于2010年3月至2012年8月完成交付，合同总值约16·77亿美元。

2009年6月25日，中国南方航空公司和广州亚组委在广州举行签约仪式，正式成为2010年亚洲运动会的官方合作伙伴，为来自亚洲45个国家和地区的运动员、裁判员、政府官员和媒体记者提供航空服务。

2010年1月20日，南航又与空中客车签订了购买20架a320系列飞机的协议，按目录价格计算，每架飞机7690万美元，交易总金额15·38亿美元（约合人民币105亿元）。该批飞机将于2011年至2013年期间交付。同年3月，中国南方航空在上海及香港增发了价值107·5亿元人民币（约合15·7亿美元）的新股，用以支付未偿还贷款。12月，南航为子公司厦门航空引入新股东，并注资14·6亿元人民币，以期进一步提高厦门航空的经营管理水平和盈利能力。

2011年1月25日，中国南方航空获skytrax颁授“四星级航空”证书，成为中国首个获评四星级的国有大型航空公司，也是目前营运规模最大的四星级航空公司；6月22日，又获颁skytrax 2011年度进步最快航空公司荣誉。同年南航先后新增奥克兰、第比利斯、温哥华等航点，其中广州-奥克兰航线为中国内地首条直飞新西兰的航线。而在中国-澳大利亚航线上，南航运力所占的份额比例已达52%，成为国内中澳航线的最大承运人。2011年10月15日中国南方航空公司在首都机场接收了第一架空客a380，成为中国首家、全球第七家运营空客a380飞机的航空公司。

2012年9月24日，南方航空与国企河南民航发展投资有限公司订立合资合同协议成立合资公司中国南方航空河南航空有限公司，以拓展在河南的航空及配套业务，注册资本为60亿元，南航将出资36亿元（人民币，下同），占合资公司60%的权益。合资公司的经营期限为20年，经营期限届满前一年内，经合资公司股东同意，可以延长经营期限。

2013年6月2日，中国南方航空公司在广州新白云机场接收了中国第一架从西雅图艾弗雷特机场发出的波音787，这意味着南航是中国首家运营波音787飞机的航空公司。

2018年6月21日，中国南方航空公司称，已上线机票退票和改期新功能，无论在哪里购买的机票，都可以完成机票退改，2小时内到账。

大事记

2017年

南航与美国航空联姻，美国航空入股

2011年

中国南方航空公司首架a380飞机成功完成首飞

南航已从利比亚接回4655名中国公民

南航与广西壮族自治区人民政府签订“十二五”战略合作框架协议

南航荣膺“skytrax四星航空公司”

建设世界一流国际化规模网络型航空公司

南航春运首日客座率接近85%

南航做好春运准备 温馨提醒助客成行机票

南航将开通国内航空公司首条新西兰航线

南航春运加班4557班 “亲情速递”优惠机票

南航春运期间安排两岸加班80班

南航2010年最后一个航班平稳降落

2010年

南航成功运送亚残运圣火来到广州

南航亚运展馆揭开面纱 a380豪华座椅抢先体验

南航首架a380完成机体结构总装，进入系统安装与测试阶段

南航安全战略掀开新篇章

空姐英语技能大比武 全力备战广州亚运会

南航亚运火炬传递航班抵达青岛

南航向海南灾区捐款1000万元

中国银联与南航建立全面合作伙伴关系

海南省政府与南航签订战略合作协议

南航呼叫中心荣膺行业内“奥斯卡”大奖

“南航明珠”中信信用卡正式发布

南航与人保财险签署战略合作协议

2009年

南航与深圳签署协议 共建区域性航空枢纽。

南航荣获“新世纪十年信息化建设优秀单位”。

南航建成国内首家“白金机场”。

南航与中移动签署战略合作协议 强强联手助旅客共享信息化便利。

"中国亚运空姐招募大汇" 广州选区电视晋级赛落下帷幕。

南航台湾分公司今日成立 南航成为首批在台成立分公司的大陆企业。

南航被评为“首选国内航线航空公司” 2009第四届“读者票选旅游金榜”调查评比南航获此殊荣。

航空业奥斯卡评选出炉 南航被评为“中国最佳航空公司”。

南航位列中国企业信息化500强国内民航首位。

南航被评为“中国最佳商务舱航空公司” 南航第四次荣获ttg旅游大奖。

南航与大韩航扩大代码共享合作。

航空业奥斯卡评选出炉 南航被评为“中国最佳航空公司”。

2017年至今

2017年6月28日，中国南方航空公司于河南南阳机场启用国内首个人脸识别智能化登机系统。无需证件、登机牌，在登机口前，旅客只需“刷脸”即可秒速开闸登机。

2018年7月，中国南方航空股份有限公司正式开通三亚至伦敦直飞航线。

2023年3月30日，中国南方航空股份有限公司与阿联酋国家航空公司阿提哈德航空在线签署了谅解备忘录（mou），双方将在此基础上探索更深入和更广泛的合作，为旅客提供更加便捷和优质的出行体验。

2024年4月25日，沈阳-法兰克福航线正式开航。

2024年7月1日，喀什至香港的首条客运直飞航线正式开通。

2024年9月3日，南航将开通乌鲁木齐至埃里温航线，这是我国首条至亚美尼亚的定期航线。

2024年8月19日6时50分，中国南方航空cz8705航班从长白山机场起飞，标志着南航正式开通长白山-成都往返航线。

2024年8月29日上午8时19分，南航首架c919飞机从上海浦东国际机场起飞，以调机航班飞往广州白云国际机场，飞机在10时15分左右抵达。南航举行接机仪式欢迎首架c919飞机正式入列。

2024年11月15日起，南航接收的c919国产大飞机执飞成都天府至广州往返航班。

2024年11月18日，“中国茅台号”彩绘客机a350首航仪式在广州举行。从“贵州茅台号”创新升级而来的“中国茅台号”，是南航首架a350商业彩绘飞机，也将成为连接中国与世界的一张靓丽“空中名片”，为茅台开启新的文化传播窗口。

2024年11月27日，记者从南航海南分公司获悉，第六届海南岛国际电影节将于12月4日至10日在海南三亚举行。作为海南电影节的“指定航空承运商”，南航提前安排技术分公司的机务工程师对“海南岛国际电影节号”彩绘飞机进行全面“体检”，确保旅客出行安全平稳。同时，南航还编排了电影节期间彩绘飞机的航班计划，主要执行三亚往返北京、上海、广州、深圳等地的航班，助力提升海南电影节的知名度和影响力。

2024年12月11日，南航c919飞机首飞广州-海口航线，自12月16日起开始定期执飞广州-海口“南航快线”航班。

2024年12月19日，佛山市政府与中国南方航空股份有限公司签订战略合作协议。

2024年12月28日，南航沈阳-广州-迪拜航线正式启航。这条新开通的航线是东北地区首条飞往阿联酋的定期航线。

2024年12月31日，中国南方航空cz5509航班从广州白云国际机场顺利起飞，前往文莱首都斯里巴加湾市。这是c909飞机（原arj21）首次执飞广州-文莱航线，创下南航c909飞机执飞航线最长航程近2400公里的纪录。

2025年1月17日，广州至长沙cz3380航班降落长沙黄花国际机场，标志着国产大飞机c919在湖南的飞行“首秀”顺利完成，该航班也是春运期间南航c919飞机新增的首条航线。2月24日，南方航空将开通乌鲁木齐—广州—吉隆坡往返航线，这是新疆首条始发至马来西亚的定期国际航线。3月30日-10月25日，民航将执行夏秋航班计划。届时，南航将新开郑州-喀什直飞航线，增加郑州-深圳、重庆、沈阳航班，在郑执飞航线达50条。自4月10日起，中国南方航空每周新增4班往返广州至尼泊尔加德满都航班，至此，该航线每周航班量增至11班。自4月16日起，南航将新开广州-武汉-金昌航线，每周4个往返。5月7日起，中国南方航空公司加密中国广州至孟加拉国首都达卡的直飞航线。4月15日报道，南航已在c919飞机上全面部署自主研发的中国民航首个飞机健康监控系统“天瞳系统”。该系统是c919安全飞行的得力助手，能够“隔空诊脉”，实时远程监测飞机技术状况和运行状态，提前预测潜在故障，大大提高了飞机的安全性和可靠性。

2025年4月15日起，中国南方航空在广州至上海虹桥往返航线的基础上，将“爱宠进客舱”服务推广至北京大兴、深圳、哈尔滨、乌鲁木齐、海口、三亚、大连等七个城市，覆盖46条直达航线。旅客可携带爱宠进入客舱相伴飞行，全程更安心、更放心。

2025年4月28日至10月24日期间，中国南方航空将恢复延吉至符拉迪沃斯托克国际航线。

2025年6月4日晚，中国南方航空cz3383航班顺利抵达南阳姜营机场。这是南航首次使用国产大飞机c919执飞广州—南阳航线，也是c919在支线机场的商业首航。

2025年6月16日，南航开通北京大兴-杜尚别新航线。

2025年6月21日起，南航计划新增张家界-长春航线，每周二、四、六各执行一个往返。

2025年6月，中国南方航空股份有限公司与埃塞俄比亚国家航空公司埃塞俄比亚航空签署了合作谅解备忘录。该备忘录立足于中非网络互联互通，旨在深化双方合作关系，探索更广泛的合作领域，以满足中非之间日益增长的旅客出行需求。6月，南方航空公告称，2025年5月，公司及所属子公司客运运力投入同比上升4·99%，旅客周转量同比上升8·43%，客座率为85·91%，同比上升2·73个百分点。

自2025年6月16日起，南航黑龙江分公司将复飞哈尔滨—新潟航线。

2025年7月1日至8月30日期间（将于每周二、周六执飞），南航黑龙江分公司将复飞哈尔滨至符拉迪沃斯托克（海参崴） 国际航线。

2025年7月1日起，南航新增10个“爱宠进客舱”服务场站，在原先覆盖广州、上海虹桥、北京大兴、深圳、哈尔滨、乌鲁木齐、海口、三亚、大连等9个场站的基础上，持续拓展至沈阳、长春、武汉、长沙、南宁、郑州、贵阳、重庆、杭州、上海浦东等10个场站，覆盖超200条直达航线。

2025年7月2日起，南航计划新增长春⇌宁波、长春⇌西宁两条直飞航线。

2025年7月8日，南航发布消息，南航广州—北京大兴往返航线支持旅客在航班计划起飞时刻之前15分钟完成安检并抵达登机口，即可登机。

2025年7月，广州-奥克兰-悉尼国际货运新航线正式开通。7月14日，南航湖北分公司推出“爱宠进客舱”服务后迎来首位宠物旅客。8月3日起，南航新疆分公司开通阿克苏-北京大兴直飞往返航线。

加入天合

2007年11月15日上午，南航在北京人民大会堂举行隆重仪式，宣布正式加入天合联盟。这标志着南航成为中国首家加入世界航空联盟组织的航空公司，中国民航运输企业实现真正意义上与国际接轨，也标志着中国民航国际化进程迈出了重要一步。

南航加入天合联盟时间表：

2004年8月28日，签署加入天合联盟意向书

2006年6月28日，签署gaaaa协议

2007年7月，天合联盟入门标准完成情况一次内审

2007年8月，不合格项整改期

2007年9月，天合联盟入门标准完成情况二次内审

2007年10月，天合联盟检查

2007年11月15日，在北京举行加入庆典活动

2019年1月1日退出天合联盟成员