漳州师范专科学校

1958年春，原龙溪师范学校增设师范大专班；同年5月，以龙溪师范专科学校名义招收中文科1班；同年8月，师范大专班正式招生，设中文、数学、物理三科。

1958年9月，经中共龙溪地委研究决定，在已创办的师范大专班基础上成立漳州大学，下设师范学院、工学院、医学院、艺术学院。1959年春，由于形势变化，漳州大学宣布停办。

1959年，经龙溪地委报请省教育厅核准，在原漳州大学师范学院的基础上建立漳州师范专科学校，校址位于漳州市郊湖里村蝴蝶山，共设有六个学科（七个专业）：中文、外语（英语、俄语）、政教、数学、物理、化学；1959年秋正式列入省高校招生计划。

福建第二师范学院

1963年7月，经国务院批准，由漳州师范专科学校、厦门师范学院、泉州师范学院、南平师范学院四所高校合并建立福建第二师范学院，并在漳州师专原校址加以扩建。学院设置中文、英语、数学、物理四个系及一个俄语专修科，学制四年；合并伊始，学院中文系在漳州蝴蝶山办学，英文系、数学系在厦门鼓浪屿办学，物理系则寄读于福建师范学院（今福建师范大学），随后数学系迁入漳州蝴蝶山；

1966年1月，原漳州农校迁至圆山，其芝山校址划入福建第二师范学院，英文系随即迁入漳州芝山（今市政府芝山大院）。1966年秋，福建第二师范学院停止招生。1969年，福建第二师范学院与福建师范学院合并。1970年，受政治运动冲击，两校停办。

1972年，福建第二师范学院裁撤，从创办到“下马”，共有毕业生1340名。

漳州师范学院

1977年底，国家恢复高考招生，龙溪地区举办中学师资训练班，招收恢复高考后首批高考学生。1978年秋改为龙溪师范大专班，设置了7门学科，校址在龙溪师范学校。1983年6月，经福建省人民政府批准并报请教育部和国务院审核批准，在原龙溪师范大专班的基础上，正式成立漳州师范专科学校，校址位于漳州市芗城区县前直街。学校共设中文、英语、数学、物理、化学等五个学科，学制3年。

1984年12月，原福建省龙溪地区行政公署呈请福建省人民政府，拟以“漳州师范专科学校”为基础，恢复“福建省第二师范学院”，建议改名为“漳州师范学院”。1985年1月，福建省高等教育厅回复龙溪地区行署，同意在漳州师范专科学校的基础上复办“福建第二师范学院”，并改名为“漳州师范学院”。1985年3月，成立漳州师范学院筹备委员会。1985年5月至9月，福建省教育厅、福建省高等教育厅、福建省人民政府分别呈请国家教委要求复办“福建第二师范学院”，改名为“漳州师范学院”。

1986年6月，经原国家教育委员会同意，在漳州师范专科学校的基础上建立漳州师范学院，招收4年制本科生和3年制专科生，设中文、数学、英语、物理、化学等系、科。

1992年，漳州师范学院获学士学位授予权。2003年，漳州师范学院获硕士学位授予权。2007年被列为福建省重点建设高校。2009年，成为教育硕士专业学位研究生培养单位。2009年10月，被列为教育部“农村学校教育硕士师资培养计划”推荐及培养学校。2012年，获批“服务国家特殊需求博士人才培养项目”，具有博士学位授予权。

现今闽南师范大学

2013年4月，经教育部同意，漳州师范学院更名为闽南师范大学。2016年9月，经福建省人民政府同意，漳州农业学校停止办学，圆山校址主体全部并入闽南师范大学。2018年1月，闽南师范大学圆山校区正式揭牌。

2018年3月，闽南师范大学入选福建省一流学科建设高校。2021年9月，入选第二批国家语言文字推广基地拟入选单位名单。 2021年11月，中国语言文学专业获批为一级学科博士学位授权点。 2022年起，闽南师范大学成为依据台湾科技院校联合统一测试（简称“统测”）成绩招收台湾高中毕业生的首批试点高校。 2022年11月，闽南师范大学入选为福建省一流大学建设高校。 2022年4月，被列为教育部“师范教育协同提质计划”参与帮扶院校。2023年10月，批准为全国单独招收台湾学生（即“对台单招”）试点高校。

2025年5月13日，闽南师范大学与厦门市仙岳医院签署合作共建协议。