学校前身

辽宁水利职业学院

1951年9月1日，在辽宁省辽阳市沙土坎成立了东北水利专科学校，隶属东北水利总局。

1952年，初搬迁至沈阳市皇姑区黄河大街七段二号。

1955年7月7日，学校更名为水利部沈阳水利学校，隶属水利部。

1957年9月6日，经辽宁省水利局请示、水利部批准，水利部沈阳水利学校与辽宁省水利学校合并，由辽宁省水利局领导。11月1日，合并后的学校定名为辽宁省水利学校。

1958年11月25日，根据辽宁省水利水电建设局文件，将原“辽宁省水利学校”改为“辽宁省水利水电学院”，由辽宁省水利水电建设局领导。

1963年9月1日，根据辽宁省水电厅文件，撤销辽宁省水利水电学院的建制，恢复辽宁省水利学校。

1965年9月1日，根据辽宁省委决定，辽宁省水利学校搬迁至朝阳县西大营子北山山麓。

1966年—1976年，文革期间朝阳地区革委会决定将水校与朝阳地区农校、农机校合并，定名为朝阳地区农业学校，后更名为朝阳农学院。

1977年12月28日，朝阳地区革委会撤销朝阳农学院建制，分别成立辽宁省水利学校、朝阳地区农业科学研究所、朝阳地区农业学校和朝阳地区农业机械化学校，并从1978年1月1日起开始对外办公。

1980年2月20日，经辽宁省人民政府批示辽宁水利学校在沈阳选定地址，重新建校。

1983年9月20日，学校迁至沈阳市虎石台镇。

2000年8月18日，经辽宁省人民政府批准，将辽宁省水利学校并入沈阳农业大学。12月16日，沈农大（人）字[2000]17号文件成立沈阳农业大学高等职业技术学院。

2012年9月20日，经辽宁省人民政府批准，同意沈阳农业大学高等职业技术学院从沈阳农业大学剥离，成立辽宁水利职业学院，隶属辽宁省教育厅。

辽宁林业职业技术学院

1951年9月，于吉林省郑家屯建校，校名为东北林业专科学校，隶属于东北人民政府林政局。

1952年春，校址迁至沈阳。

1953年初，根据政务院的有关文件，将学校改名为沈阳林业学校，归属林业部。

1956年，根据林业部文件，学校改名为辽宁省沈阳林业学校，由林业部和辽宁省林业厅双重领导。

1958年，经辽宁省委同意将学校改名为沈阳林业专科学校。

1959年，学校改名为辽宁省林业学校。

1960年，经省政府批准，学校与沈阳农学院森林系合并，成立辽宁林学院。

1961年9月，辽宁省委决定停办辽宁林学院，恢复辽宁省林业学校。

1965年，学校迁至抚顺市清原县南口前镇。

1980年，校址迁回沈阳市。

2003年1月，经辽宁省人民政府批准，在原国家级重点中专基础上独立升格为高等职业学院，更名为辽宁林业职业技术学院。校址位于辽宁省沈阳市苏家屯区，隶属于辽宁省林业厅。

合并组建

2018年9月，辽宁水利职业学院与辽宁林业职业技术学院合并，组建辽宁生态工程职业学院。

2019年10月，辽宁生态工程职业学院现代学徒制项目顺利通过教育部验收。12月，学校当选全国职业院校（农林）课程和教材建设战略联盟副理事长单位。

2021年，学校获批兴辽卓越院校a等建设单位。