1996年，克服重重困难，从化在流溪河畔的低洼河滩地上建起一所全新的全寄宿完全中学，从化市第六中学就此创办。

2001年，获评为从化市一级学校。

2003年，获评为广州市一级学校。

2004年，为满足从化六中长远的发展需要，政府部门划拨40亩土地扩建新校区。

2006年，获评为广东省一级中学。

2011年，获评为广东省国家级示范性普通高中。

2013年，广州市执信中学对从化六中实施深度帮扶，建立合作共建关系，从化六中又迈进了崭新的时代，加挂广州市执信中学从化实验学校。

2014年，“淳和文化”特色课程通过广州市第三批特色课程重点立项。该校被评为广州市义务教育阶段特色学校，同年，由于从化市的撤市设区，学校同步更名为广州市从化区第六中学。

2015年，被评为广州市普通高中特色学校。

2017年，广州市从化区人民政府与广州市执信中学签署协议，从化六中纳入广州执信教育集团，将按照集团化办学思路与广州市执信中学一起同步教研，接受着强校的资源辐射。

2019年，流溪中学教育集团成立，从此开启集团化办学新模式。9月12日，中共广州市从化区委机构编制委员会正式批复，同意广州市从化区第六中学更名为广州市从化区流溪中学。

同年9月24日，广州市从化区流溪中学（原从化六中）举行新校牌揭幕仪式。

2023年8月，广州市流溪中学教育集团扩容至6所学校，分别为流溪中学、河东中学、太平中学、神岗中学、桃园中学、流溪中学实验小学。

以上资料参考：