建院以来，共承担国家、省、市等各类科研项目226项，仅“五”以来承担完成的各级各类科研项目70项，其中农业部聊城玉米综合试验站，鲁西棉花试验站，高产、优质玉米新品种原原种扩繁基地建设等5 个国家级基地建设项目先后落户我院，省农业产业化重大科研项目 《 高产、优质、多抗、粮饲兼用型玉米新品种选育与开发 》我院是主持单位之一，也是山东省5个主持单位中唯一的地市级单位。以上平台的建设，为我院科技创新奠定了坚实的基础。建院以来，共培育出小麦、玉米、棉花等主要农作物新品种24个，其中玉米有2个具有自主知识产权的新品种通过国审。“十五”以来，共审定具有自主知识产权的玉米新品种7个，小麦新品种3个。农作物新品种及其配套栽培技术、植保、土肥等研究获各级各类科技成果奖126项，其中省部级奖26项。在省级以上学术刊物发表论文500余篇。据不完全统计，我院的科研成果在省内外累计推广面积达18亿亩以上，创社会经济效益900亿元以上，为山东省及周边地区的农业增效、农民增收，为保障粮食安全做出了突出贡献。

为加强我院科技创新成果的迅速转化，融资580万元成立了禾丰种业有限责任公司，年繁育经营优质小麦、玉米、棉花良种600万斤以上；投资1300万元成立了绿之源生物工程有限责任公司，年生产脱毒马铃薯5500吨、脱毒蔬菜、花卉种苗2000万株、微型薯原原种1万公斤，各类成品花、半成品花30余万盆，已成为“江北水城”一道亮丽的风景线，受到“水城人”的普遍关注。