内部设置5个职能部门：

党政办公室（综合协调与督查考核）

投资促进部（招商引资与项目对接）

项目服务部（企业监管与营商环境）

经济发展部（经济运行监测与统计）

财政审计部（预算编制与审计监督）

下设事业单位规划建设中心（已注销）曾负责市政建设招标，财政局本级组织实施生态维护采购。