江苏海洋大学有苍梧校区、通灌校区、宋跳校区和墟沟校区4个校区。

苍梧校区

该校区位于江苏省连云港市海州区苍梧路59号，坐落在国家5a级风景名胜区、《西游记》文化发源地花果山西麓，总占地2193·83亩，校舍面积65·71万平方米。

通灌校区

该校区位于江苏省连云港市通灌南路108号，校园面积约200亩。校区内有完备的教学、生活设施，并备有计算机房、语音室、多媒体、学生食堂、清真食堂、体育馆、塑胶田径场等办学所必需的基本设施，总建筑面积94382平方米。

宋跳校区

该校区位于江苏省连云港市昌生路2号，紧邻连云港市国家级经济技术开发区。校区占地面积300亩，建筑面积8万余平方米，教学、生活设施配套，是江苏省“园林式单位”、连云港市“城市绿化先进单位”。宋跳校区距离江苏海洋大学主校区7公里，现有在校生2900余人。

墟沟校区

该校区位于江苏省连云港市连云区大港西路28号。