中心主要职能包括：

传染病监测预警与应急处置，2020年购置9台核酸检测设备提升新冠肺炎检测能力

制定区域疾病防控策略，开展慢性病等公共卫生问题研究

实施卫生监督执法，查处医疗机构传染病防控违规行为

组织健康教育，提升居民健康素养

承担食品安全风险监测评估和现制现售饮用水管理