2017年5月22日，京东集团与西安航天基地签订了京东全球物流总部、京东无人系统产业中心、京东云运营中心合作协议，五年内计划投资205亿元。

2017年10月23日，京东物流与中国人民解放军空军后勤部达成“物流军民融合”战略合作。5年内，双方将在运输配送、仓储管理、物资采购、信息融合、科研创新、力量建设、拥军服务、配套支撑等方面展开深入合作，最终达到后勤物流“成系统、整建制、全覆盖”融合的目的，真正将军事物流打造为国民经济向空军战斗力转化的纽带。

2018年6月，京东物流与华贸国际物流股份有限公司（简称“华贸物流”）签署战略合作协议，双方将重点聚焦跨境物流，并在仓储、运力、物流科技、电商等领域展开全方位合作。

2018年10月30日，京东物流与新宁物流签署战略合作协议。双方将在一体化供应链解决方案、物流科技、城市智能物流、跨境电商等多个领域展开全方位深度合作，谋求智能物流产业链和服务链更高水平的共赢发展。

2019年3月，京东物流与北京华鸿有限公司签署合作协议，双方将在仓储管理、配送服务等医药物流领域展开合作，共建一体化医药物流生态，提升整个医药供应链效率。

2020年8月14日，京东物流将收购知名现代化综合运输企业跨越速运集团有限公司的控股权益，收购对价为30亿元。

2022年，京东物流将作为"抖音好物年货节"的特邀物流合作伙伴，为抖音商家提供全链路物流履约保障。

2023年11月，牵头成立全国数字商贸行业产教融合共同体。

2025年2月27日，京东物流与福建圣农控股集团有限公司正式签署战略合作协议。双方将围绕供应链效能优化、资源整合等领域展开深度合作。4月，京东物流与微博电商正式宣布达成深度战略合作，双方将围绕京东物流服务展示、商家生态共建及用户体验升级展开全面协同。4月25日，京东物流与佛吉亚（中国）投资有限公司正式签署战略合作协议。双方将围绕绿色低碳仓储运输、京碳惠scemp供应链碳管理平台、物流碳排放因子库等领域展开深度合作。