学校前身

惠州农业学校

1948年，惠阳县平潭农校成立。

1950年，学校改为东江第一农业实验学校，校址设在惠阳县马鞍围。

1952年，学校与博罗县农业技术学校合并迁博罗县汤泉，改名为广东省东江高级农业技术学校。

1955年，学校并入新会农校，后更名为广东省惠阳农业学校。

1958年，学校改为华南农学院惠阳分院。

1959年，华南农学院冬惠阳分院撤销后，学校改称广东省博罗农业学校。

1968年，学校因校址被惠阳地区“五•七”干校占用，职工编入干校而停办。

1973年，学校复办。

1979年，学校改称惠阳地区农业学校。

1991年，学校定名为惠州农业学校。

2001年，学校被广东省定为第一批全省35所中等职业教育实训中心之一。

2004年3月，学校被首批认定为“国家级重点中等职业学校”。

2007年，学校增挂“惠州工业贸易学校”校名。

惠州工业科技学校

1974年，惠阳地区农业机械技工学校成立，由惠州市地区机械工业局主管。

1978年，学校改为广东省惠阳地区农业机械学校。

1980年，学校暂停招生，转为在职培训为主。

1985年2月，学校复办，定向招收初中毕业生。

1988年，广东省行政区划调整，惠阳地区改为地区级建制市，学校遂更名为惠州市农业机械学校，行政上隶属于惠州市机械工业总公司。

1992年，学校更名为惠州机电工业学校。

2004年，学校在成立30周年之际更名为惠州工业科技学校。

合并办学

2012年11月，惠州农业学校和惠州工业科技学校整合成立惠州工程技术学校。

升格办学

2017年3月，惠州工程技术惠州工程职业学院经广东省人民政府批复同意设立；5月，学校在中华人民共和国教育部备案；9月，学校挂牌。

2022年6月8日，“惠州工程职业学院红十字会”成立；11月23日，惠州市妇女联合会在学校成立“惠州市妇女联合会严丽娜执委工作室”。

2023年3月，学校被授予首批“广东省退役军人教育培训（实训）示范基地”。

2024年1月16日，“惠州市新一代电子信息产教联合体”在学校成立；12月，学校在广东省教育厅2024年高等职业教育“创新强校工程”考核中获评“b类”。