截至2025年4月，湖北中医药大学设有昙华林校区和黄家湖校区，占地总面积1610亩，建筑总面积54·3万平方米。

昙华林校区

昙华林校区位于湖北省武汉市武昌区昙华林特1号，原址是我国近代最早开办高等教育的学校之一——文华学院。该校区与附属医院连为一体，主要用于临床教学。

黄家湖校区

据2024年10月学校官网数据，黄家湖校区位于湖北省武汉市洪山区黄家湖西路16号。距昙华林校区13·5公里，交通便利，占地面积1410亩，2004年3月启动建设，2005年秋季启用，2008年11月整体落成。校舍建筑面积30万平方米，道踏绿化40万平方米。