区财政局内设18个股室：办公室、综合股、法规税政股（行政审批股）、预算股、国库股、政府债务管理股、经济建设股、行政政法股、教科文股、社会保障股、产业发展股、农业股、金融股、预算绩效管理股、资产管理股、政府采购管理股、人事教育股、离退休干部股、机关党委办公室

局属事业单位8个：黄州区农村财政服务中心、黄州区国有资本运营服务中心、黄州区政府投资评审中心、黄州区财政监督局、黄州区非税收入管理局、黄州区会计管理局、黄州区国库集中收付中心、黄州区财政局信息中心

乡镇财政所10个：赤壁街道财政所、东湖街道财政所、禹王街道财政所、南湖街道财政所、西湖街道财政所、堵城镇财政所、路口镇财政所、陶店乡财政所、火车站经济开发区财政所、陈策楼镇财政所