医院成立于1979年12月5日，1996年贺县卫生局批准贺县卫校与我院合署办公，实行一套人马、两块牌子的办公方式。

1997贺县成立县级市后，贺县中医院改称为贺州市中医医院。

1998年1月率先成为梧州地区首家二级甲等医院。

1998年6月，与原贺州市（县级市）八步镇第二卫生院合并为贺州市中医医院。

2001年10月31日被自治区卫生厅授予全区示范中医院。

2007年3月经广西壮族自治区卫生厅批准，成为“爱婴医院”。

2007年6月贺州市卫生局确定医院为市级新型农村合作医疗定点机构。

2008年3月13日经自治区卫生厅审核批准为三级甲等医院。

2008年被确定为广西残联/cbm防盲项目定点医院。

2009年1月4日成为高等医学院校a级临床教学基地。

2009年6月19日成为广西中医学院附属贺州医院。

2010年，经自治区中医药管理局批准，成为中医药防治艾滋病基地。

2012年8月26日经国家三级中医医院等级评审专家组评审，顺过通过三甲复评。