现有传染病和流行病两个省医学重点学科，承担一批重大科技攻关项目和自然科学基金项目，先后获得国家级科技进步奖3项，省部级科技进步奖70余项。同时，与who、联合国儿童基金会、美国cdc、日本jica等20多个国际组织、国外机构和学术团体建立了合作关系。编辑出版的《河南预防医学杂志》发行全国。

拥有高效液相色谱仪、液相色谱质谱联用仪等大批国际领先的卫生检验检测仪器设备，其中万元以上设备870台件，总价值约1·1亿元。实验室建设和管理规范，拥有26个bsl－2实验室、2个全省独有的bsl－3实验室、省a级spf实验动物室和生物资源库。2004年，卫生检测检验中心获得国家实验室认可证书和计量认证合格证书，认可项目达到636项，并被商务部第一批授予“全国食品安全检测机构”称号。艾滋病确认、脊灰监测、麻疹监测等实验室均通过who或卫生部认证。

中心建有全省卫生系统唯一的bsl-3实验室、51个bsl-2实验室（含10个加强型bsl-2实验室和2个加强型移动bsl-2实验室）、省a级spf动物实验室、菌（毒）种保藏中心、国家级艾滋病确证实验室、who认证的脊灰实验室、结核病参比实验室、淮河流域癌症综合防治项目实验室，以及首批“国家致病菌识别网”区域中心实验室等。拥有全省疾控系统唯一的省级重点实验室——河南省传染病病原生物重点实验室，建有省发改委传染病分子医学河南省工程实验室。拥有省医学重点学科6个（传染病学、食品安全、医学寄生虫学、慢性病流行病学、地方病学、艾滋病学）；省医学重点实验室8个（河南省艾滋病防治研究实验室、河南省结核病参比实验室、河南省病原微生物医学重点实验室、河南省食品安全风险监测医学重点实验室、河南省免疫预防医学重点实验室、河南省寄生虫病原与媒介医学重点实验室、河南省食源性疾病病原学溯源医学重点实验室、河南省慢性非传染性疾病流行病学重点实验室）。拥有各类仪器设备总价值1·56亿元，达到国内一流水平。通过国家认可委的认可和原卫生部的计量认证，认证认可项目达976项，目前已经获5项国家检测检验认可资质。被商务部第一批授予“定点食品安全检测机构”。2014年获国家食品药品监督管理局“保健食品注册检验机构”资质认可，被原国家卫计委确定为“国家食品安全风险监测河南分中心”。中心拥有省级创新型科技团队3个（新发传染病预防控制优秀科技创新型团队、艾滋病与结核病等重大传染病综合防治研究团队、河南省食品安全创新型科技团队），获批“河南省博士后创新实践基地”和首个“河南省实验室生物安全培训基地”。先后获得国家级重大科研成果8项，省部级科技进步奖100余项。其中，“消灭丝虫病研究”“新布尼亚病毒发现及其致发热伴血小板综合征预防控制”分别获河南省科技进步一等奖，填补了河南省医药卫生类省科技进步一等奖的空白。2014年以来，主持国家“十三五”科技重大专项1项，承担国家科技重大专项11项；获批国家自然科学基金项目3项，省级项目71项，市厅级项目240项；科研项目经费16227·5万元；获省级科技奖12项，市厅级科技奖98项，发表学术论文1353篇，其中sci收录104篇，单篇最高影响因子达到45·54。