民国时期

1912年8月，河南都督张镇芳提议，河南临时议会议定创建“河南留学欧美预备学校”，择定“河南贡院”为校址。经陈善同举荐，委任林伯襄为校长。以林伯襄先生为代表的众人在开封清代贡院旧址创办河南留学欧美预备学校。

1915年，河南留学欧美预备学校教学楼——六号楼动工。1922年8月，河南省政府批准，以契税为教育专款，河南教育经费独立实现。

20年代初，冯玉祥将军拨出专款，作为河南大学的筹备基金，并经省议会讨论将学校定名为“中州大学”，委派留学欧美预备学校校长张鸿烈为筹办委员并任命（其）为中州大学校长，以留学欧美预备学校为基础创办大学。1923年3月3日，中州大学举行开学典礼，设文、理两科。

战争时期

抗日战争期间，河南大学先后辗转于河南信阳、南阳、洛阳，陕西西安、宝鸡等地。1934年8月，河南大学土木工程系并入天津北洋大学（现天津大学）。1938年，河南大学畜牧系与西北农专、西北联大农学院组建国立西北农学院。1942年，省立河南大学改为国立河南大学。

建国初期

1949年5月，河南省人民政府在河大校园重建河南大学，定名为河南人民革命大学。6月，以中原大学医学、教育专业五百余名学员和河南行政学院四百余名学员为基础，河南人民革命大学正式成立。河南省人民政府主席吴芝圃兼任校长，原中原大学教务长张柏园任副校长，实际主持工作。原河南大学教授嵇文甫任副校长。7月，河南省人民政府接回滞留苏州的一千二百余名河南大学师生，并入河南人民革命大学。

1950年3月，河南人民革命大学恢复河南大学校名。新的河南大学设文教学院、农学院、医学院、行政学院。1952年院系调整，河南大学农学院独立为河南农学院，医学院独立为河南医学院，行政学院独立发展为河南政法管理干部学院，水利系调入武汉水利学院，财经系调入中南财经学院， 植物病虫害并入华中农学院，畜牧兽医并入江西农学院，土木系和数理系数学专业并入湖南大学，湖南大学地理系一部分并入河南大学。

1953年8月6日，教育部和政务院文教委员会决定河南大学与平原师范学院合并，统称为河南师范学院，在开封、新乡两地办学，分称一院、二院。1955年8月16日，中共河南省委对河南师范学院进行调整，决定将文科集中在开封办学，理科集中在新乡办学。1956年11月，河南师范学院一院、二院分别独立为开封师范学院和新乡师范学院。开封师范学院设中文、历史、地理、外语4系。1959年，开封师范专科学校并入开封师范学院，新增物理、化学、数学、生物4系，后又增设政教系和体育系。1962年7月，河南艺术学院并入，建立艺术系；河南体育学院并入体育系；郑州大学地理系并入地理系。至此，学校有中文、历史、政教、地理、外语、数学、物理、化学、体育、艺术10个系。

1975年，开封师院创办信阳分院，1978年独立为信阳师范学院。1979年，学校更名为河南师范大学，增设教育系。1984年5月，河南师范大学恢复河南大学校名，增设化工、经济、管理、生物、土木工程、计算机等专业。2000年6月，河南大学、开封医学高等专科学校、开封师范高等专科学校合并组建新的河南大学。同年，河南大学成为教育部确定建立“国家体育与艺术师资培养培训基地”的12所高校之一。

1987年1月，河南省秘书专科学校更名为河南大学郑州分校，王绍龄任校长，并于当年开始招收秘书学专业学生。

21世纪始

2001年10月，位于开封市龙亭区的河南大学新校区建设提上日程。2002年，入选国家体育与艺术师资培养培训基地。2004年7月，江泽民同志视察学校时亲笔书写“与时俱进，开拓创新，把河南大学办成全国一流高校”的题词。2005年，河南大学分别与中国科学院研究生院、中国社会科学院研究生院签订“联合建设河南大学研究生院合作的协议”。2006年，入选国家大学生文化素质教育基地。2008年10月17日，河南省人民政府和教育部签订省部共建河南大学协议，河南大学正式进入省部共建大学行列。2009年4月，习近平同志到访河南大学。2010年，河南大学郑州龙子湖校区启动建设。

2011年5月，被教育部评为“全国毕业生就业典型经验高校”。2012年9月25日，河南大学迎来百年诞辰。时任中共中央政治局常委、国务院总理温家宝为河南大学建校100周年题词“办好河南大学、振兴中原教育”。河南省委、省政府把河南大学作为河南省重点建设高校。

2016年3月，经教育部批准，河南大学与美国迈阿密大学合作设立河南大学迈阿密学院（miami college of henan university”）。同年9月，河南大学获批国家“111计划”学科创新引智基地，是河南省首个入选高校。同年10月20日，入选国家支持高校创建的首批16个中华优秀文化艺术传承基地之一。2017年，入选国家级大学生创新创业训练计划；1月18日，教育部办公厅下发《教育部办公厅关于公布首批深化创新创业教育改革示范高校名单的通知》，河南大学成为首批全国深化创新创业教育改革示范高校；9月，入选国家首批“双一流”建设高校。同年9月28日，省委宣传部与河南大学共建新闻与传播学院签约仪式暨院务委会第一次全体会议在河南大学召开。2018年11月，教育部公布第一批中华优秀传统文化传承基地名单，河南大学入选。2019年4月，河南大学深圳研究院在深圳南山区大学园正式设立。

2020年6月11日，河南大学与华为技术有限公司主导的中原鲲鹏生态创新中心共建鲲鹏产业创新学院签约揭牌仪式举行。7月10日，国家知识产权局办公室、教育部办公厅联合下发《关于公布第二批高校国家知识产权信息服务中心名单的通知》，河南大学成功入选。9月，学校与国家税务总局河南省税务局签订战略合作框架协议 。10月，被国家知识产权局、教育部确定为2020年度国家知识产权试点高校。11月3日，“河南大学中医院”与“河南大学中医药研究院”挂牌仪式在开封市中医院举行。12月26日，河南大学农学院恢复重建。12月29日，依托河南大学建设的“河南大别山森林生态系统国家野外科学观测研究站”正式获批立项建设。

2021年7月13日，河南大学三亚研究院合作签约暨揭牌仪式在三亚崖州湾科技城举行。9月10日，河南大学深圳研究院注册地正式迁入深圳市大鹏新区。9月25日，位于郑州市郑东新区明理路北的河南大学龙子湖校区正式启用。

2022年1月，爱尔眼科与河南大学正式达成战略合作，共建“河南大学附属爱尔眼科医院”、“河南大学爱尔眼科临床学院”、“河南大学爱尔眼科研究院”。1月24日，河南大学牵头获批先进显示与照明河南省产业技术创新战略联盟。2月14日，入选教育部公布的第二轮“双一流”高校名单。2月17日，河南大学的注册地从河南省开封市顺河区明伦街85号变更为河南省郑州市郑东新区明理路北段379号。4月6日，河南大学与濮阳市人民政府深化合作签约仪式在濮阳市迎宾馆举行。7月，河南大学对现用校徽进行升级完善。8月，由河南大学张治军教授牵头完成的“自修复纳米润滑抗磨损材料”项目，开发的纳米润滑油脂配伍技术，入选河南省十项重大科技创新成果。9月7日，河南大学党委办公室网站发布《关于成立河南大学河南戏剧学院的通知》。11月11日，河南省教育厅等十五部门发布《关于公布省级特色行业学院立项建设单位的通知》 ，河南大学申报的碳中和行业学院、智能制造与智慧土木行业学院、数字文旅行业学院获批立项建设。

2023年2月10日，河南大学碳中和研究院揭牌仪式暨碳中和高端论坛在河南大学举行。4月14日，河南大学举行“河南大学密码学院”揭牌仪式。5月26日，河南大学栾川产业技术研究院在栾川县揭牌成立。7月，崔大祥教授受聘为河南大学学术副校长、医学院院长。8月25日，河南大学、二里头夏都遗址博物馆合作共建二里头夏文化研究院。10月29日，河南大学牵头成立全国绿色算力行业产教融合共同体。

2024年7月24日，河南大学高级翻译学院揭牌仪式在河南大学明伦校区外语北楼二楼多功能报告厅成功举行。8月30日，由openatom openharmony项目群技术指导委员会与河南大学共同举办的“河南大学openharmony技术俱乐部成立大会”在郑州校区友兰学堂举行。9月6日上午，河南大学近现代中国研究院成立。12月14日下午，在2024年广东省转化医学大会期间，河南大学粤港澳转化医学研究院揭牌仪式在深圳市南山区人民医院举行。12月16日，河南大学地理科学与工程学部揭牌成立。

2025年4月，郑州市人民政府发布了《关于印发2025年郑州市重点建设项目名单的通知》，包括建设河南大学雁鸣校区。4月15日下午，新华保险河南分公司与河南大学在河南大学郑州校区隆重举行战略合作签约仪式。

2025年5月，河南大学与安阳师范学院签署战略合作协议。

2025年5月9日，河南大学先端医学研究院成立。6月28日，河南大学出版学院揭牌。