截至2025年3月，学校共有4个办学区，其中在哈尔滨市有西、南、东3个办学区，在山东省威海市荣成市设有哈尔滨理工大学威海校区。学校总占地面积164·44万平方米，教学基础设施面积98·3万平方米。

西校区

哈尔滨理工大学西区位于哈尔滨市南岗区学府路52号，哈尔滨理工大学学校管理机构就设立在此校区，设有机械动力工程学院、电气与电子工程学院、自动化学院、计算机科学与技术学院、测控技术与通信工程学院、建筑工程学院、应用科学学院、马克思主义学院、国际文化教育学院、后备军官学院、成人与继续教育学院和体育教学部。

南校区

哈尔滨理工大学南区位于哈尔滨市南岗区仪征路249号，设有经管学院、外国语学院、艺术学院、材料科学与工程学院、化学与环境工程学院。

东校区

哈尔滨理工大学东区位于哈尔滨市香坊区三大动力路23号，原为哈尔滨电工学院老校区，也是哈尔滨理工大学最老的校区，此校区设有软件学院、法学院。

荣成校区

哈尔滨理工大学在山东省威海市荣成市设有哈尔滨理工大学威海校区，位于山东省威海市荣成市学院路 2006 号，总占地面积730亩，建筑面积23·2万平方米，设有8个系、3个教学部，在校学生7100余人，教职工600余人。开设25个本科专业，覆盖工、管、经、文、艺等五个学科门类。