学校创办于1948年5月，在哈尔滨东北民主联军总部成立的“东北民主联军南岗干部子弟学校”，由林月琴同志任校长。

1949年2月，随军至天津改名为“第四野战军干部子弟学校”，由余慎同志任校长，林月琴同志改任名誉校长；同年8月，随着四野渡江南下，学校也迁到汉口，年底由王长德同志任校长。

1950年4月，更名中南军区兼第四野战军干部子弟学校，先后在汉口、庐山办学。

1950年12月，更名为“中国人民解放军第十五兵团干部子弟学校”，是中国人民解放军第四野战军在解放战争中随军南下而先后设立的四所子弟学校中的最后一所。先后在广州市东山区达道路、广东省韶关市十里亭办学。

1951年3月，更名广东军区干部子弟学校，在广州市东山区百子路办学。

1952年8月，更名华南军区干部子弟学校，在广州市沙河鸡颈坑办学。

1953年9月，改为中南军区第二干部子弟小学，在广州市石牌玉泉山办学。

1955年2月，更名广州市六一小学，先后在广州市石牌玉泉山、越秀区黄华路办学。

1958年7月，改为广州市八一中学，在广州市越秀区黄华路办学。学校下设“附属第一小学”、“附属第二小学”。附属第一小学和初中班在黄华路，原达道路的“八一小学分教处”正式命名为“广州市八一中学附属第二小学”。

1964年8月，学校由军队办学移交地方政府管理，并与广州市八一中学附属第二小学分立，原八一中学附属第二小学改名为“广州东山区八一小学”，1968年9月改名为“广州市八一学校”。

1968年8月，广州市八一中学黄华路部分更名广州市第五十三中学，在广州市越秀区黄华路办学。

1981年8月，更名广州师范学院附属中学，在广州市越秀区黄华路办学。

1994年6月，广师附中获评为广东省一级学校。

2000年9月，广州师范学院与其他单位合并成为广州大学，学校同步更名为广州大学附属中学。

2003年4月，学校获评为中国科协青少年科技创新人才培养实验学校。

2009年3月，广州大学附属中学获评为广东省国家级示范性普通高中。

2010年5月，广大附中大学城校区正式落成。

2018年5月，广大附中教育集团正式成立，是为广州市第二批3个市属教育集团之一。

2020年8月，广州大学附属中学南沙实验学校启用，是为广州市占地面积最大的十二年一贯制公办学校。

2021年11月，广州大学附属中学被评为首批广东省普通高中新课程新教材实施示范校。

2022年3月，学校入选第一批中小学（中职）思政课新结构教学评范式研究试点实验学校。

2022年9月，黄华楼校史馆在黄华楼旧址基础上开始筹建。

2023年11月，黄华楼校史馆正式落成。

以上