桂林理工大学南宁分校的前身是1985年建校的南宁有色金属工业学校。

2000年，桂林理工大学南宁分校经广西壮族自治区教育厅批准整体并入桂林理工大学，成为桂林理工大学重要的有机组成部分，从事应用本科教育和高职教育。

2004年，桂林理工大学南宁分校机械与控制工程系创建。

2011年，桂林理工大学南宁分校土木与测绘工程系成立。

2015年1月，桂林理工大学南宁分校空港校区获自治区“森林校园”荣誉称号。

2017年1月，桂林理工大学南宁分校荣获2个自治区级虚拟仿真实验教学中心（含培育项目）。

2018年2月，桂林理工大学南宁分校入选数据中国“百校工程”项目建设院校。

2020年12月4日，桂林理工大学南宁分校（扶绥校区）入选第四批自治区民族团结进步示范学校。