1998年，由教育家王屏山创办民办新安职业技术学院，是广东省教育促进会和深圳市南山区人民政府联合建立的民办公助高等院校。

2000年6月，民办新安职业技术学院经教育部批准正式建校。

2001年，学校更名为广东新安职业技术学院。

2009年4月，学校因办学条件不达标被教育部限制招生。

2022年12月，共同组建成立深圳市南山区生活垃圾分类高校联盟。

2024年11月26日，广东省广东新安职业技术学院教育发展基金会成立。12月25日，广东新安职业技术学院成立生物活性物质基因资源应用研究中心。12月30日，广东新安职业技术学院成立深圳改革开放史迹数字化研究中心。

2025年3月20日，广东新安职业技术学院与香港高等教育科技学院签署战略合作备忘录。