2009年2月27日，福州市城市地铁有限责任公司经市政府批准成立。

2009年4月30日，福州市城市地铁有限责任公司在福州市市场监督管理局登记注册。

2009年6月20日，福州市城市地铁有限责任公司揭牌仪式在福州市房地产交易中心大院举行，地铁公司揭牌运作，这标志着福州市地铁项目由前期规划阶段转入组织实施阶段。

2011年3月28日，福州地铁标志注册成为商标。

2014年2月24日，福州地铁运营分公司工商注册登记。

2014年3月14日，福州地铁资源开发分公司工商注册登记。

2015年1月1日，福州地铁运营分公司正式挂牌。

2015年5月10日，福州轨道交通设计院有限公司正式揭牌。

2015年7月30日，福州地铁资源开发有限公司工商注册登记。

2016年12月，福州中电科轨道交通有限公司成立。

2016年12月30日，福州地铁建设分公司工商注册登记。

2017年3月4日，福州地铁企业精神石标揭幕。

2017年6月13日，更名后的福州地铁集团有限公司挂牌。

2023年11月25日，成为福州儿童友好阅读联盟成员单位。

2024年9月18日，上交所债券项目信息平台显示“福州地铁集团有限公司2024年面向专业投资者公开发行公司债券”项目状态更新为“已受理”。10月8日，上交所债券项目信息平台显示“福州地铁集团有限公司2024年面向专业投资者公开发行公司债券”项目状态更新为“已反馈”。