1962年1月，福建省科学技术协会的前身中华全国自然科学专门学会联合会福建省分会和福建省科学技术普及协会两会合并成立福建省科学技术协会，同时召开第一次代表大会。

1966年，“文化大革命”期间，福建省科学技术协会活动停止。

1978年，福建省科学技术协会得到恢复。

1980年6月，福建省科学技术协会第二次代表大会召开。

1986年11月，福建省科学技术协会第三次代表大会召开。

1991年12月，福建省科学技术协会第四次代表大会召开。

1996年12月，福建省科学技术协会第五次代表大会召开。

2002年1月，福建省科学技术协会第六次代表大会召开。

2013年6月，福建省科学技术协会第八次代表大会召开。

2018年2月，福建省科学技术协会第八届委员会第七次会议在福州召开。

2024年7月23日，福建省科协第十次代表大会胜利闭幕。11月18日，第二十四届福建省科协年会开幕式暨主旨报告会在福州举行。