1、信息工作部：负责开展全省食品行业专题调查，研究提出中长期发展规划、政策性建议，收集、整理全省食品行业经济、技术信息，开展信息咨询工作，编辑《福建食品》信息刊物。

2、科技规划部：负责编制食品工业发展规划建议，安排做好技术引进、技术改造、开发、研究、推广新技术、新设备、新产品及人才培训。

3、质量管理部：负责产品质量、卫生管理、食品检测、标准制定以及优秀产品的评选和推荐。

4、市场开发部：负责国内外食品行业经济技术交流与合作、技术引进、经贸洽谈和国内外博览会。

5、办公室：负责文书、档案、人事、财务管理，办理日常行政事务。

6、《中国食品报》福建记者站