1907年，福建优级师范学堂创办的理化科。

1953年9月，由华南女子文理学院、福建协和大学等教学研究机构中的相关专业合并组成了福建师范学院物理学系。

1972年，更名为福建师范大学物理学系。

2003年，在整合和优化原物理学系和原校实验中心部分资源的基础上，组建物理与光电信息科技学院

2012年，物理与光电信息科技学院分设为物理与能源学院、光电与信息工程学院。

2025年4月15日，福建师范大学物理与能源学院与广东省梅州市蕉岭县共建“蕉岭县引才联络站”。